面对叶尔羌军队的火铳，官军自然是毫不畏惧的，官军在城头上和叶尔羌人对射，同时官军的榴弹炮还交替使用开花弹和燃烧弹攻击叶尔羌人，叶尔羌人为了发挥火铳的威力，队形自然是极为密集的，而这种密集的队形，自然就是官军的主要打击对象，在官军直瞄间瞄火力的协同打击之下，叶尔羌人很快就扛不住了，叶尔羌的第一轮进攻，除了摸到了交河城的城砖之外，一无所获。
而在阿拉沟堡，交河前卫仍旧在和从西面而来的骑兵对峙，这些蒙古人当然知道官军的阵型不好对付，这点他们是很清楚的，蒙古人的本色在这个时候还是起了作用，他们认为，如果叶尔羌的主力能够夺取交河城的话，交河前卫必然不战自退，到时候他们就可以衔尾追击的，如果要是叶尔羌的主力无法夺取交河的话，他们即便是在付出巨大的伤亡击败了交河前卫，也没有办法夺取交河城。
他们和叶尔羌汗国那些回夷是不同的，他们是原来察合台汗国的直系部落，尽管现在也信仰了回教，但是毕竟是蒙古人，并不是畏吾儿人，这点是他们和这些回夷最大的不同，他们仍旧坚持蒙古人的游牧风俗，对于定居没有任何兴趣，所以他们这次对于叶尔羌汗国进攻交河的想法本来就不是很积极，之前在夏尔沟又没官军重创，所以他们现在对于和交河前卫硬碰硬是没有任何兴趣的。
加上前一天他们也试过了，交河前卫的火力是远远强于夏尔沟的，要是硬碰硬，蒙古人的损失必然是不小的，所以他们不愿进攻，这也是其中的一个重要的原因。
而在交河城外，叶尔羌汗国的阿布都克里木汗??召集麾下的将领们商量应该怎么对付大明官军，面对官军强大的守城火力，叶尔羌人承受了巨大的伤亡，这么打下去，恐怕叶尔羌这五六万人拼光了都不见得能够拿下交河城，所以必须想其他办法，这点也得到了在场的将领们的支持，现在必须智取，这点确实现在叶尔羌汗国军队的主要想法。
一个之前在吐鲁番等地驻守的将领提出可以利用土工作业，挖掘地道，潜进到交河城下，然后在通过挖掘等办法攻城，这确实一个办法，地道毁城也是一种攻城的手段，在之前的战争实践中，穴攻也确实是一个不错的手段，尤其是交河附近的土壤，便于挖掘地道，之前这里广泛的挖掘坎儿井，作为引水的办法。
坎儿井由竖井、地下暗渠、明渠、蓄水池等四部分组成。在吐鲁番各片绿洲附近倾斜的戈壁上，可以看到排成一串一串的砾石土堆，方向由高处向绿洲延伸，那便是竖井口，是掏挖地下渠出土和通风的孔道。竖井底部一一连通即成暗渠。这些都说明这里是适合进行土工作业的，而且叶尔羌军队人数众多，现在也将整个交河城包围了起来，在这种情况之下，确实是具备进行穴攻的条件，所以阿布都克里木汗决定进行穴攻，挖掘地道进攻交河城。
但是阿布都克里木汗很清楚，要是叶尔羌军队什么都不做的话，官军势必会起疑的，所以为了掩护他们的穴攻，叶尔羌军队决定再度实施攻城作战，和之前的集中兵力攻城不同，他们也很清楚，如果队形对于密集，面对官军的优势火力，所付出的伤亡将会是极为惨重的，所以他们四面出击，然后以松散阵型接近交河城，准备使用云梯等攻城器械攻城。
面对叶尔羌的这种战法，官军自然是不会予以客气的，成箱的手榴弹被搬上了城头，然后官军的线膛燧发枪以冷枪打击叶尔羌军队的军官、传令兵等，一旦发现叶尔羌人有密集集中的趋势，就用排枪和霰弹招呼，要是真的到了城下，就是密集的手榴弹对付他们。
但是马栋并没有掉以轻心，他认为叶尔羌将领没有这么傻，昨日的大规模密集进攻，尚且没有讨到什么好处，火炮也被官军消灭的七七八八了，在这种情况下，他们怎么可能采取这种进攻方式，而且叶尔羌汗国是在原来的吐鲁番经营过的，知晓吐鲁番的地质情况，所以马栋判断，他们可能是要采取穴攻。
对于穴攻和反穴攻，官军的经验是十分之丰富的，从春秋时期起就有相关的论述，马栋作为专门研究城市攻防作战的将领，对于这些自然是十分之熟稔的，反穴攻首先就是要确定地道的位置，在城的高处设隙望哨，严密监视敌军动静，一旦发现有挖地道的迹象，如反常的土方堆积和浊水流淌等，立刻在城内相应方向紧贴城墙根挖井，五步一井（或三丈一井），在井底放置新陶缸，上蒙薄牛皮，使听力聪敏者伏缸侦听。因为敌人开凿地道发出的声响在地下传播的速度快，衰减小，容易激起缸体共振，因此用这种方法能够侦测到地道的方位。
只要能够掌握敌人地道的位置，就好处理这些事情了，不管是水攻、火攻、烟熏甚至是直接的短兵相接，都是处理这些地道的办法，所以马栋当即命令设置陶瓮，监听地下的情况。
而身在轮台的西域总督吴兑接报交河被围之后，也立即采取了措施，吴兑首先传檄戚金部，要求官军加快速度行军，同时命令李成梁部在扫荡伊犁河谷之后南下给叶尔羌汗国制造压力，同时动员轮台诸卫的卫所军士，准备解交河之围，向交河方向派遣尖哨，探查叶尔羌军队的情况。
而在朝廷，和卫拉特四部的谈判也已经进入了最终的阶段，被李成梁率领官军骑兵爱过之后的卫拉特四部终于明白了一个道理，就是现在的大明已经不是之前的大明了，如果不接受大明的条件，但是真的有能力让卫拉特四部在此地没有立足之地的。