武藏的病是京都患过的胃溃疡复发。作者之所以这样断定，是因为作者在熊本调查武藏事迹时，武藏的研究者，曾任武藏会会长的岛田氏说，武藏的死因可能是得了今日所谓的胃溃疡，对岛田此一说法，作者深表同意。
如果死因真的如此，那么，五十岁前后似乎已出现症状。
宽永十七年（一六四○年），细川家正式聘请时，武藏的回信称：
近年已成病者……
在小仓他似乎也因此病相当痛苦。
武藏并不豪饮，也不是美食家，体躯壮伟，是近乎六尺的巨人，有大力，想象中饭量应该很惊人，而且常吃粗食。这到了晚年，岂非成了祸根？
武藏吐血倒下了。立刻请医生诊治，还是吐血不止，伊织大吃一惊，三更半夜向忠真侯紧急报告。御医即刻兼程赶来，医生劝他绝食，并要绝对安静。武藏得重病的消息当夜传遍全藩，藩士们大为吃惊，终致发展成无法复原的谣传。
但武藏本人根本不惊讶，也并不以为就会死。但他遵守医生的嘱咐。武藏不是宿命论者，知道养生如果不善，可治之病也无法治好。
病况已脱离脸境，日渐复原。但未脱离险境前，有十天，武藏大都沉睡，连动也未动。医生说：“能翻身就有救。”说完即告辞而去。
伊织跟妻子浪娘放下心坐在武藏枕边。
“父亲，真惊人。十天来连动都未动，耐力真强……”
武藏微笑回答：“病也是战场。起先拥抱着自己跟自己的生命与病痛作战，之后已浑忘病痛，而是与未来对决。”
他立刻换了一副严肃的表情说：“伊织！吾道遥远，敌人无数。虽说悟得万里一空，但这仍是一个小天地。我的一生一定结束于战斗，而无喘息的间隙。伊织，这样看来，我反而舒服多了。这次如果完全复原，我要立刻回答肥后，答应仕宦。”
“是的，希望如此，我想殿下望眼欲穿，正等待父亲呢。”
“嗯，由利小姐也……”
武藏说了这一句，就噤口闭眼。