取而代之的是一个由他亲自设计并直接领导的全新部门，木叶特殊事态处理与未来战略规划局，代称天眼。
这个部门整合了日向一族的白眼，奈良一族的智囊，山中一族的通讯，以及大蛇丸的情报网络，与根部的行动能力。
它成为了一个集情报、分析、指挥、行动于一体的绝对权力中心，而凌轩就是这个中心唯一的大脑。
随后，一场席卷整个木叶村史无前例的系统升级，便以一种不容抗拒的姿态正式拉开序幕。
旧有的秩序在绝对的理与力面前被毫不留情地碾碎，而全新的规则则以一种野蛮而又具有生命力的姿态，迅速地缠绕覆盖，并最终彻底取代这片古老废墟之上的所有一切。
天眼部门如同一只无所不见的眼睛，悬浮在木叶村的上空。它上承火影下达各部，整合了情报、分析、指挥、行动所有权限，成为凌轩贯彻自己意志，掌控整个村子的锋利权柄。
而作为这场变革的亲历者纲手，这位性格火爆的五代目火影，却出人意料地选择了全盘的沉默与配合。
她将自己关在火影办公室，日复一日地处理着由凌轩的天眼系统筛选和优化过，只需要她进行最终盖章的大量无聊文件。
她不再酗酒也不再赌博，因为纲手知道自己早已将整个木叶的未来，连同她自己的命运一起，押在了一场此生之中最大也最疯狂的赌局之上。
而赌局的另一头坐着的，是那个她永远也看不透的青年。
当外界因为凌轩所掀起的风暴而天翻地覆时，他本人则早已回到隔绝整个世界的冰冷实验室。
对凌轩而言，权力的更迭秩序的重建，都只是为了更好地进行实验而进行的一次，再普通不过的场地清理而已。
他真正的乐趣永远都在于，对未知与惊喜的珍贵战利品进行最彻底的解剖。
“感觉怎么样，长门前辈。”
一间带有生命维持装置的密室之中，凌轩看着眼前这个身体依旧干瘦，但眼中却不再有任何痛苦与仇恨的红发青年。
在他的身边，小南正一脸复杂地守护着。
“我感觉……”长门缓缓地抬起手，感受着自己这双依旧充满力量，却又从未像现在这般安宁的轮回眼，“我感觉自己仿佛获得了新生。”
他能清晰地感觉到，自己与那尊给他带来无尽力量，也带来无尽痛苦的外道魔像之间的链接，正在被一股更加温和，也更加强大的力量所优化。
这股力量正在修复长门因为过度使用轮回眼，而早已被透支得千疮百孔的生命力。
“你的轮回眼很强大。”凌轩缓步走到他的面前，“但你的身体却太弱了，你就如同一个试图用孩童的身体去挥舞一把开山巨斧的莽夫，每一次使用力量都在加速自己的死亡。”
“所以，我为你准备了一份小小的礼物。”
凌轩伸出手，在他的掌心之中，静静地躺着一小份散发着庞大生命气息，属于初代火影的细胞组织。
这是神兵计划中最完美，也是最基础的素材。
“我将用它为你重塑一具足以承载神之力的全新容器，而你作为回报。”